2. Zentrum und Süden – bis zu den Misool-Inseln
Diese Route beginnt mit einem Besuch der Misool Inseln. Nach der Einschiffung in Sorong unternehmen Sie eine 16- bis 18-stündige Überfahrt und erreichen die Inseln am nächsten Morgen. Die Misool Inseln beherbergen die artenreichste Meeresfauna der Welt. In 4 bis 5 Tagen werden Sie von Insel zu Insel fahren und beeindruckende Tauchplätze wie Balbulol, Farondi, Wayil und Fiabacet sowie das berühmte Boo Window und die Magic Fountains erleben. Sie haben auch die Möglichkeit, im Jellyfish Lake zu schwimmen oder eine Wanderung über den Love Lake mit atemberaubender Aussicht zu unternehmen.
Die südliche Route endet in der Regel in der zentralen Region, wo Highlights wie Piaynemo, Kri Island oder das Dorf Arborek besucht werden. Diese Route dauert mindestens 9 Tage.

Dieses 9-tägige Reiseprogramm umfasst Zentral- und Süd-Raja Ampat.

3. Zentral, Nord & Süd – Ganz Raja Ampat in einer Tour
Für diejenigen, die ganz Raja Ampat erkunden möchten, bieten einige Schiffe Routen an, die die zentralen, nördlichen und südlichen Regionen umfassen. Dafür sind mindestens 12 Tage erforderlich.

4. Nur Zentral-Raja Ampat – kurz und landschaftlich reizvoll
Wenn Sie nur wenig Zeit haben oder während der Nebensaison (Mai bis Oktober) in Raja Ampat unterwegs sind, finden Sie möglicherweise Kreuzfahrten, die sich ausschließlich auf das zentrale Gebiet konzentrieren und eine Dauer von 6 bis 8 Tagen haben. Diese Region ist von Sorong aus am besten erreichbar und umfasst einige der bekanntesten Orte des Archipels.

Allerdings sind solche reinen Zentralrouten eher die Ausnahme – und aus gutem Grund. Denn der große Vorteil einer Kreuzfahrt liegt gerade darin, auch die weiter entfernten Regionen zu erreichen, abseits der Gebiete, in denen sich ohnehin die meisten Unterkünfte befinden (mehr dazu weiter unten). Wer eine Route wählt, die neben dem zentralen Teil auch den Norden oder Süden einschließt, besucht natürlich auch die wichtigsten Highlights des zentralen Gebiets – insbesondere die Insel Arborek, wo regelmäßig mit Mantarochen geschnorchelt oder getaucht werden kann. Ein weiteres Muss ist Piaynemo mit seinen markanten Karstinseln aus Kalkstein und dem berühmten Aussichtspunkt über eine türkisfarbene Lagune. Die Riffe rund um Kri Island gehören zu den artenreichsten der Welt – riesige Fischschwärme, Schildkröten, Riffhaie und farbenfrohe Korallen erwarten Sie. Fast alle Kreuzfahrten beinhalten zudem einen Besuch in einem lokalen Dorf oder einen Ausflug zur Vogelbeobachtung, bei dem mit etwas Glück die berühmten Paradiesvögel auf den Inseln Gam oder Waigeo gesichtet werden können.